Base de données de phénotypage profond des anomalies cranofaciales au cours du développement. FACE and SKULL for Key Innovative Data Science.

Un grand nombre de maladies génétiques rares convergent en présentant des anomalies du développement crâniofacial (plus de 2.100), quelles que soient les modalités
d'expression de la maladie. La syndromologie et la dysmorphologie visent à réaliser des diagnostics performants par une analyse clinique simple et immédiate : l'inspection des caractéristiques physiques crânio-faciales. La solidité de ces approches est justifiée par le grand nombre de diagnostics génétiques pertinents et par la confirmation de leur origine génétique. Cependant, plusieurs observations suggèrent que cette approche atteint ses limites. liées à trois facteurs principaux :

1. épidémiologique, avec un nombre croissant de syndromes rapportés par next generation sequencing (NGS), tous rares ; 2. scientifique, avec une variabilité phénotypique pour un même génotype ; 3. académique, avec le défi de l'enseignement de ces compétences cliniques détenues par peu de spécialistes.

La caractérisation clinique des phénotypes “tête et cou” est donc un enjeu majeur face à la question scientifique principale : une variabilité d’expression majeure. Variabilité entre individus atteints, dans une même famille, mais aussi avec l'âge chez une même personne.
FACE.S-4-KIDS est un projet de base de données ambitieux abordant la question scientifique de l'expression variable des troubles craniofaciaux, vers une prise en charge clinique optimale (diagnostic, pronostic), et des plans de traitement personnalisés.
FACE.S-4-KIDS tire parti de larges cohortes de patients bien caractérisés et génotypés, de services experts en malformations cranio-faciales (médicaux, chirurgicaux, imagerie), ainsi que de laboratoires de sciences fondamentales, en un même site. Depuis des années ils génèrent des quantités considérables de données (dossiers patients, imagerie, photographies, génomique, modèles animaux et cellulaires).

FACE.S-4-KIDS a sélectionné 4 malformations prototypiques, s’exprimant avec des traits cranio-faciaux, et récapitulant les différentes questions ontologiques, embryologiques et anatomiques soulevées :

• les craniosténoses liées à la signalisation FGFR ( (syndromes de Crouzon, Pfeiffer, Apert et Muenke),
• les achondroplasie / hypochondroplasie,
• les ostéogenèse imparfaite,
• les anomalies dentaires, et fentes palatines et séquences de Pierre Robin,
  chacune soulevant des questions scientifiques spécifiques liées à la variabilité.

En réunissant l'expertise multidisciplinaire des équipes de recherche d'Imagine : Bases moléculaires et physiopathologiques de l'ostéochondrodysplasie, Embryologie et génétique des malformations et Laboratoire de Bioinformatique Clinique avec Data science Plateform, et en associant 8 CRMR, 3 réseaux nationaux et 1 ERN, nous visons à répondre aux questions fondamentales, collectives mais aussi spécifiques de chaque archétype, liées à l'expression variable : origines des résultats imprévisibles après un traitement chirurgical dans les craniosténoses liées aux FGFR, relation entre le phénotype et la gravité dans l'achondroplasie, liens entre les phénotypes dentaire et osseux dans l'ostéogenèse imparfaite et facteurs prédictifs des résultats fonctionnels et cognitifs dans les fentes palatines ou séquences de Robin.