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  <citation>
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      <titl>Annotator®, Base de données du Programme "Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT)® "</titl>
      <IDNo>FRESH-PEF8214-fr</IDNo>
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  </citation>
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      <titl>
                Annotator®, Base de données du Programme "Cartes d’Identité des Tumeurs (CIT)® "            </titl>
      <altTitl>
                    Annotator®                </altTitl>
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                    Mira AYADI                                                                                                                            </AuthEnty>
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                    Aurélien DE REYNIES                                                                                                                            </AuthEnty>
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                    Fabien PETEL                                                                                                                            </AuthEnty>
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      <othId affiliation="Plus de 80 projets de recherche ont &#xE9;t&#xE9; men&#xE9;s dans le cadre du programme CIT, sur plus de 20 types de cancer diff&#xE9;rents, et ont conduit &#xE0; de nombreuses publications dans des revues internationales." type="collaboration">
                                    </othId>
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                                            LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER (LNCC)                    
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                Portail Epidémiologie France (PEF)            </prodPlac>
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                                            LIGUE NATIONALE CONTRE LE CANCER (LNCC)                    
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                    Mira;AYADI
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                    Fabien;PETEL
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      <distDate date="2026-06-16"/>
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            </biblCit>
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    <authorizingAgency>CNIL                </authorizingAgency>
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    <subject>
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                    Ligue Nationale contre le Cancer</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    altérations</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    génome</keyword>
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                    réarrangements chromosomiques</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    expression des gènes</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    microARNs</keyword>
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                    patterns de méthylation</keyword>
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                    exons</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    cellules cancéreuses</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    médecine personnalisée</keyword>
      <keyword vocab="" vocabURI="">
                    mutations</keyword>
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                        Oncologie                                                        <ExtLink title="ESV" URI="http://data.europa.eu/8mn/euroscivoc/5784b7f1-c7ce-49d9-9f38-aebcda0ff41d"/>
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      <topcClas vocab="health theme">
                        Immunologie médicale                                                        <ExtLink title="ESV" URI="http://data.europa.eu/8mn/euroscivoc/7a3cf568-46ba-4840-be8f-f22fc030139f"/>
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                        Tumeurs                                            </topcClas>
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                        Déterminants comportementaux : Addictions                    </topcClas>
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                        Déterminants biologiques : Prédispositions génétiques                    </topcClas>
      <topcClas vocab="health determinant">
                        Déterminants environnementaux : Autres                    </topcClas>
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                        Déterminants comportementaux                    </topcClas>
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                        Déterminants liés au système de santé : Consommation des soins                    </topcClas>
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                        Déterminants socio-démographiques et économiques : Emploi                    </topcClas>
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                        Déterminants biologiques                    </topcClas>
      <topcClas vocab="health determinant">
                        Déterminants environnementaux                    </topcClas>
      <topcClas vocab="health determinant">
                        Déterminants liés au système de santé                    </topcClas>
      <topcClas vocab="health determinant">
                        Déterminants socio-démographiques et économiques                    </topcClas>
    </subject>
    <abstract contentType="purpose">Caractériser de façon exhaustive et combinée les altérations du génome à l’origine des cancers (mutations et réarrangements chromosomiques, expression des gènes et des microARNs, patterns de méthylation, variations des exons, etc.) CIT développe ainsi une vision intégrée du fonctionnement des cellules cancéreuses, et ces travaux constituent la base d’une médecine personnalisée, adaptée aux caractéristiques génomiques de chaque tumeur.</abstract>
    <abstract contentType="abstract">null</abstract>
    <sumDscr>
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      <collDate event="end" date="2014-01-01"/>
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                    France
                                            <concept vocab="ISO" vocabURI="fr"/>
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                Individus            </anlyUnit>
      <universe level="type" clusion="I">Patients                    </universe>
      <universe level="sex" clusion="I">Masculin                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D008297"/>
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      <universe level="sex" clusion="I">Féminin                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D005260"/>
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      <universe level="age" clusion="I">Nouveau-né (naissance à 28j)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D007231"/>
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      <universe level="age" clusion="I">Nourrisson (28j à 2 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D007223"/>
                                                    </universe>
      <universe level="age" clusion="I">Petite enfance (2 à 5 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D002675"/>
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      <universe level="age" clusion="I">Enfance (6 à 12 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D002648"/>
                                                    </universe>
      <universe level="age" clusion="I">Adolescence (13 à 18 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000293"/>
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      <universe level="age" clusion="I">Adulte (19 à 24 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D055815"/>
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      <universe level="age" clusion="I">Adulte (25 à 44 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000328"/>
                                                    </universe>
      <universe level="age" clusion="I">Adulte (45 à 64 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D008875"/>
                                                    </universe>
      <universe level="age" clusion="I">Personne âgée (65 à 79 ans)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000368"/>
                                                    </universe>
      <universe level="age" clusion="I">Grand âge (80 ans et plus)                                                            <concept vocab="MeSH" vocabURI="http://id.nlm.nih.gov/mesh/D000369"/>
                                                    </universe>
      <universe clusion="I">Les critères d’inclusion sont spécifiques à chaque projet accepté dans le Programme CIT, et dépendent des questions biologiques et cliniques des porteurs de projet associés. Les études peuvent concerner des patients suivis en milieu hospitalier, ou des patients déjà inclus dans un essai clinique prospectif. Le consentement éclairé des patients a été obtenu auparavant. Les pathologies étudiées sont soit des tumeurs pédiatriques, soit des cancers de l’adulte, et peuvent concerner aussi bien des tumeurs solides que des hémopathies malignes ou des lymphomes. L’accès aux données est sécurisé, et restreint pour chaque projet aux investigateurs concernés.                    </universe>
      <dataKind>Données cliniques</dataKind>
      <dataKind>Données paracliniques</dataKind>
      <dataKind>Données biologiques</dataKind>
    </sumDscr>
  </stdyInfo>
  <studyDevelopment>
    <developmentActivity type="primary evaluation">
      <description>Evénements de santé/morbidité
Evénements de santé/mortalité
Autres</description>
    </developmentActivity>
  </studyDevelopment>
  <method>
    <dataColl>
      <sampProc>Autre                                                            <concept vocab="CESSDA" vocabURI="Other"/>
                                                    </sampProc>
      <sampleFrame>
        <frameUnit>
          <unitType>Via des structures (services ou établissements de santé</unitType>
        </frameUnit>
        <frameUnit>
          <unitType>écoles</unitType>
        </frameUnit>
        <frameUnit>
          <unitType>entreprises…)</unitType>
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      </sampleFrame>
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        <sampleSizeFormula>[10000-20000[ individus                        </sampleSizeFormula>
      </targetSampleSize>
      <collMode>Transcription et saisie d’informations dans un enregistrement structuré                                                            <concept vocab="CESSDA" vocabURI="Transcription"/>
                                                    </collMode>
      <collMode>Entretien avec le participant (dont clinique)                                                            <concept vocab="CESSDA" vocabURI="Interview"/>
                                                    </collMode>
    </dataColl>
    <notes>Etude observationnelle</notes>
    <notes subject="research type">
                        Etude observationnelle                    </notes>
    <anlyInfo>
      <respRate>Fin 2013, la base de données ‘Annotator’ du Programme CIT contenait les informations histologiques, cliniques, biologiques de 11000 échantillons tumoraux (patients anonymisés), tous types de cancer confondus, et 18000 expériences haut-débit avaient été réalisées.</respRate>
    </anlyInfo>
    <stdyClas>Inconnu</stdyClas>
  </method>
  <dataAccs>
    <setAvail>
      <avlStatus>
                            Accès réservé                                                    </avlStatus>
    </setAvail>
    <useStmt>
      <restrctn>L’accès aux données est sécurisé, et restreint pour chaque projet aux investigateurs concernés.</restrctn>
    </useStmt>
  </dataAccs>
  <othrStdyMat>
    <relMat>Accès restreint sur projet spécifique</relMat>
  </othrStdyMat>
</stdyDscr>
<dataDscr>
</dataDscr></codeBook>
